(通用)纳米孔测序仪

[ 基础信息 ]
生产国家 : 英国
制造厂商 : Oxford Nanopore
购置日期 : 2021-12-20
规格型号 : MinION MK1C
[ 分类信息 ]
设备类型 :
设备编号 : 20221123aa
[ 联系信息 ]
联系人 : 王冰
存放地址 : ArrayC208
联系电话 : 15853213653
联系邮箱 : wb8320091@163.com
[ 附加信息 ]
主要附件及配置 :

主要功能及特色 :

1. 应用类型:全基因组、外显子测序、靶向测序、宏基因组、全长转录体(cDNA)、直接RNA测序、表观遗传学。
2. 样本类型:基因组DNA、扩增子/PCR产物、cDNA、RNA。

主要规格及技术指标 :

4.1流动槽(flow cell):1个MinION/Flongle测序芯片槽
4.2预装软件:Linux操作系统、MinKNOW、Guppy、EPI2ME
4.3 CPU:ARM 6核处理器
4.4GPU:256核GPU
4.5内存:8 GB RAM
4.6储存:内置1 TB固态硬盘,支持USB及SD移动存储
4.7触摸屏:OLED触摸屏
4.8网络支持:Wi-Fi,GSM、UMTS及LTE模式的蜂窝网
5. 仪器性能:
5.1测序通道数量:512(2048)/MinION测序芯片槽或216/Flongle测序芯片槽;
5.2起始样品量:pg~ug级;
5.3运行时间:1min~72hrs(按需可控),测序中途可随时终止,对芯片清洗后重新利用;
5.4测序速度:400bp/s(DNA)、70bp/s(RNA);
5.5运行数:1个flow cell实验;
5.6原始数据存储。
6. 性能指标
6.1文库制备时间:10min(Rapid)或2hrs(Ligation);
6.2 DNA/RNA直接测序(DNA无需扩增、RNA无需转换成cDNA即可进行测序);
6.3 获取序列时间:运行2min,并可以根据实验需求设置测序反应时间;
6.4 序列条数:4.4 Million(百万)reads(以10kb长度计算);
6.5读取长度:纳米孔读取DNA/RNA片段的整个长度,到目前为止最长的读取片段>2Mb,常规从200bp至2Mb;
6.6测序数据产量:10~30 Gb/MinION flow cel;200Mb~2Gb/Flongle flow cel;
6.7序列准确性:Raw read Modal 97%;
6.8碱基修饰:直接检测碱基修饰信息(甲基化检测);
6.9集成设备:仪器本身为高性能计算机,可实时完成数据获取,存储以及碱基转换(basecalling)。

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[ 开放机时安排 ]
[ 参考收费标准 ]